Resumo As bactérias foram isoladas de amostras de suco de maçã fresco de lojas de três diferentes localidades de Lahore. A análise de amostras dos mercados Liberty, Anarkali e Yateem khana mostram diferentes níveis de contaminação. Havia bactérias patogênicas e não patogênicas em todas as amostras e foram identificadas pelos testes morfológicos e bioquímicos. A maioria dos plasmídeos de bactérias patogênicas tinha 4 kb em seu tamanho molecular. A ribotipagem do sequenciamento do gene do RNA ribossômico 16S foi realizada para confirmar a cepa de Helicobacter pylori e Gluconobacter oxydans. A maior sensibilidade de 210 mm foi mostrada por Enterobacter sp. contra disco de azteromisina (15µg) enquanto Micrococcus sp. foi altamente resistente a todos os antibióticos aplicados. A resistência a antibióticos de bactérias patogênicas também foi verificada contra extratos de plantas de Ricinus communis, todos os patógenos bacterianos isolados foram resistentes, mas apenas E. coli foi inibida em 300µl dos extratos. A presença de bactérias patogênicas nas amostras de suco de maçã deveu-se à contaminação da água de esgoto na água potável, enquanto algumas dessas bactérias patogênicas vieram da árvore da maçã e outras de armazéns de frutas.

Abstract Bacteria were isolated from samples of Fresh Apple juices from shops of three different localities of Lahore. Analysis of samples from Liberty, Anarkali and Yateem khana Markets show different levels of contamination. There were pathogenic and non-pathogenic bacteria in all samples and were identified by the morphological and biochemical tests. Most of the plasmids of pathogenic bacteria were 4kb in their molecular size. Ribotyping of 16S ribosomal RNA gene sequencing was done to confirm Helicobacter pylori strain and Gluconobacter oxydans. The highest sensitivity of 210mm was shown by Enterobacter sp. against Aztheromysine disk (15µg) while Micrococcus sp. was highly resistant against all of the Antibiotics applied. The antibiotic resistance of pathogenic bacteria was also checked against Ricinus communis plant's extracts, all isolated bacterial pathogens were resistant but only, E.coli was inhibited at 300µl of the extracts. Presence of pathogenic bacteria in Apple juice samples was due to contamination of sewage water in drinking water while some of these pathogenic bacteria came from Apple's tree and other from store houses of fruits.

Resumo Entre os cogumelos comestíveis, Pleurotus eryngii é único por causa de seu sabor e seu admirável perfil medicinal e nutricional. O Paquistão é um país agrícola com diversas culturas. No entanto, os resíduos das culturas hortícolas e agronômicas são desperdiçados sem aproveitamento na cadeia alimentar. Assim, um estudo foi realizado para avaliar o desempenho de resíduos de culturas com custos relativamente baixos e facilmente disponíveis, ou seja, algodão, arroz, trigo, mostarda e castanha-de-água, para o aumento da produtividade e nutrição de cepas de P. eryngii P9 (China) e P10 (PSU-EUA). Os resultados revelaram que os atributos morfológicos, ou seja, função do micélio, desenvolvimento de frutos, rendimento e eficiência biológica, foram significativamente maiores usando resíduos de algodão em comparação com outros substratos. Em relação aos atributos bioquímicos, ou seja, sólidos solúveis totais (12,67 °Brix), fenólicos (259,6 mg / 100 g), umidade (92,3%) e teores de ácido ascórbico (2,9 mg / 100 ml), também foram significativamente maiores usando resíduos de algodão. Já os teores de acidez (0,30%), açúcares redutores (7,67%), não redutores (4,33%) e açúcares totais (12%) foram os mais elevados na palha de mostarda. A análise de nutrientes dos substratos mostrou que os níveis de nutrientes aumentaram após a colheita da cultura em comparação com os níveis antes da colheita. Os resultados gerais revelaram que os resíduos de algodão e a palha de mostarda são substratos promissores para o melhor crescimento de P. eryngii e têm potencial na melhoria da produtividade e nutrição. Além disso, a cepa P10 apresentou melhor desempenho em comparação com a P9.

Abstract Among edible mushrooms, Pleurotus eryngii is unique due to its flavor, admirable medicinal and nutritional profiling. Pakistan is an agricultural country diverse in various crops. However, the residues of the horticultural and agronomic crops are wasted without utilization in the food chain. Hence, a study was performed to assess the performance of relatively low-cost, easily available crops residues i.e. cotton, rice, wheat, mustard and water chestnut for yield and nutrition enhancement of Pleurotus eryngii strains P9 (China) and P10 (PSU-USA). The results revealed that morphological attributes i.e. mycelium run, fruit development, yield and biological efficiency were significantly higher by using cotton waste as compared to other substrates. Regarding biochemical attributes i.e. total soluble solids (12.67 °Brix), phenolics (259.6 mg/100g), moisture (92.3%) and ascorbic acid contents (2.9 mg/100ml) were also significantly higher by using cotton waste. Whereas, acidity (0.30%), reducing sugar (7.67%), non-reducing (4.33%) and total sugars contents (12%) were found highest by using mustard straw. Nutrient analysis of substrates showed that nutrient levels were increased after harvesting of crop as compared to before harvesting levels. Overall results revealed that cotton waste and mustard straw are promising substrates for Pleurotus eryngii better growth and have potential in yield and nutrition enhancement. Moreover, P10 strain performed better as compared to P9.

Resumo O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente “SARS-CoV-2”, foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o “SARS-CoV-2”, embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre “SARS-CoV-2” e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que “SARS-CoV-2” tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.

Abstract Novel coronavirus (nCoV) namely “SARS-CoV-2” is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the “SARS-CoV-2” although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among “SARS-CoV-2” and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that “SARS-CoV-2” has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.

RESUMO: Estresses abióticos e baixo acúmulo de biomassa são as principais restrições para se atingir o potencial de rendimento de Leymus chinensis. Foi conduzido um experimento para melhorar a biomassa e a correlação de atributos de acúmulo de biomassa com pigmentos fotossintéticos, substâncias osmóticas e antioxidantes sob aplicação foliar de diferentes fitorreguladores. O experimento foi conduzido em Xilinguole, Mongólia Interior, China, usando um delineamento em blocos completamente casualizados com cinco repetições. Os tratamentos consistiram de água (controle); BA5 = aplicação de BA (6-benzilaminopurina) a 5 mg L-1; BA25 = aplicação de BA a 25 mg L-1; BA50 = aplicação de BA a 50 mg L-1; BR0,02 = aplicação de BR (brassinosteroide) a 0,02 mg L-1; BR0,2 = aplicação de BR a 0,2 mg L-1; BR2 = aplicação de BR a 2 mg L-1; AG10 = aplicação de AG (ácido giberélico) a 10 mg L-1; AG50 = aplicação de AG a 50 mg L-1; e AG100 = aplicação de AG a 100 mg L-1. A aplicação de todos os fitorreguladores melhorou significativamente a biomassa, os ajustes osmóticos, os pigmentos fotossintéticos e as atividades antioxidantes, em comparação com o controle. No entanto, os resultados mais promissores foram encontrados com a aplicação de BR a 0,2 mg L-1. As maiores atividades de clorofila a/b, glutationa e ascorbato peroxidase foram registradas com 25 mg L-1 BA. Em conclusão, 25 mg L-1 BA, 0,2 mg L-1 BR e 10 mg L-1 AG apresentaram resultados mais promissores que os de outras concentrações para os atributos avaliados.

ABSTRACT: Abiotic stresses and poor biomass accumulation are chief constraints to accomplish potential yield in Leymus chinensis. An experiment was conducted to improve biomass and correlation of biomass accumulating attributes with photosynthetic pigments, osmotic substances and antioxidants under foliar application of different plant growth substances. The experiment was conducted at inner Mongolia Xilinguole, China, using a Randomized Complete Block Design and 5 replications. The treatments consisted of water (control); BA5 = application of BA (6-benzylaminopurine) at 5 mg L-1; BA25 = application of BA at 25 mg L-1; BA50 = application of BA at 50 mg L-1; BR0.02 = application of BR (brassinosteroid) at 0.02 g L-1; BR0.2 = application of BR at 0.2 mg L 1; BR2 = application of BR at 2 mg L-1; GA10 = application of GA (gibberellic acid) at 10 mg L-1; GA50 = application of GA at 50 mg L-1 and GA100 = application of GA at 100 mg L-1. Application of all plant growth substances significantly improved biomass, osmotic adjustments, photosynthetic pigments and antioxidant activities compared to control. However, the most promising results were found with 0.2 mg L-1 BR. The highest chlorophyll a/b, glutathione and ascorbate peroxidase activities were recorded with 25 mg L-1 BA. Conclusively, 25 mg L-1 BA, 0.2 mg L-1 BR and 10 mg L-1 GA exhibited more promising results than other concentrations for the evaluated attributes.

OBJETIVO: Avaliar a percepção de médicos residentes em radiologia de 4º ano sobre as melhores modalidades de imagem na investigação de neoplasias e trauma. MATERIAIS E MÉTODOS: Vinte e sete médicos residentes de 4º ano de quatro programas de residência em radiologia americanos participaram do estudo. Aos participantes foi perguntado sobre a melhor modalidade de imagem para se avaliar o cérebro e a coluna vertebral, pulmões, abdome e o sistema musculoesquelético. As modalidades de imagem disponíveis foram: RM, TC, ultrassonografia, PET e radiografia simples. Todos os achados foram comparados com os Critérios de Adequação de Exames de Imagem e Radioterapia do ACR. RESULTADOS: A RM foi escolhida como melhor modalidade de imagem para se avaliar neoplasias encefálicas, espinhais, abdominais e musculoesqueléticas por 96,3%, 100%, 70,4% e 63% dos residentes, respectivamente. A TC foi escolhida por 88,9% dos residentes para avaliar neoplasias pulmonares. A modalidade de imagem ótima para se avaliar trauma foi a TC para lesões encefálicas (100%), espinhais (92,6%), pulmonares (96,3%), abdominais (92,6%) e grandes lesões traumáticas musculoesqueléticas (74,1%); a RM foi escolhida para lesões esportivas (96,3%). Observou-se concordância com os critérios de adequação do ACR. CONCLUSÃO: Houve concordância entre a percepção dos residentes sobre as melhores modalidades de imagem para avaliação de neoplasias e trauma e os critérios de adequação do ACR.

OBJECTIVE: Our purpose was to assess 4th year radiology residents' perception of the optimal imaging modality to investigate neoplasm and trauma. MATERIALS AND METHODS: Twenty-seven 4th year radiology residents from four residency programs were surveyed. They were asked about the best imaging modality to evaluate the brain and spine, lungs, abdomen, and the musculoskeletal system. Imaging modalities available were MRI, CT, ultrasound, PET, and X-ray. All findings were compared to the ACR appropriateness criteria. RESULTS: MRI was chosen as the best imaging modality to evaluate brain, spine, abdominal, and musculoskeletal neoplasm in 96.3%, 100%, 70.4%, and 63% of residents, respectively. CT was chosen by 88.9% to evaluate neoplasm of the lung. Optimal imaging modality to evaluate trauma was CT for brain injuries (100%), spine (92.6%), lung (96.3%), abdomen (92.6%), and major musculoskeletal trauma (74.1%); MRI was chosen for sports injury (96.3%). There was agreement with ACR appropriateness criteria. CONCLUSION: Residents' perception of the best imaging modalities for neoplasm and trauma concurred with the appropriateness criteria by the ACR.

The efficacy of the Metarhizium anisopliae strain ARSEF 6911 was determined in the laboratory and field against two sugarcane pests, Microtermes obesi Holmgren and Odontotermes obesus Rambur (Termitidae: Isoptera). The susceptibility of both termite species to different conidial suspensions (1 × 10(10), 1 × 10(8), 1 × 10(6) and 1 × 10(4) conidia/ml) was determined in laboratory. All conidial suspensions were able to induce mortality. Termite mortality caused by the fungal suspensions was dose dependent. There were no significant differences in the LT50 values between species. Field evaluation of M. anisopliae alone or in combination with diesel oil and thiamethoxam was carried out in two growing seasons (autumn 2005 and spring 2006) at two sites located in Punjab, Pakistan. Dipping the sugarcane setts in these suspensions was tried to determine their effects on germination and percentage of bud damage to sugarcane setts. All treatments significantly reduced termite infestation compared to the untreated control. The combined treatment of M. anisopliae and diesel oil significantly reduced insect damage by attaining higher germination > 55% and lower bud damage < 5.50% at both sites in both seasons. The results suggest that the application of M. anisopliae and diesel oil in combination might be a useful treatment option for the management of termites in sugarcane.